Thanh bên bài viết
Số lượt xem PDF: 23
VAI TRÒ CỦA KỸ THUẬT MALDI-TOF MS TRONG ĐỊNH DANH VI KHUẨN NONTUBERCULOUS MYCOBACTERIA (NTM)
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Đánh giá tổng quan tài liệu về ưu nhược điểm của kỹ thuật MALDI -TOF MS trong định danh loài, dưới loài Nontuberculous Mycobacteria (NTM).
Đối tượng và phương pháp: 23 tài liệu nghiên cứu được lựa chọn từ các cơ sở dữ liệu y học trực tuyến bao gồm Pubmed, Google scholar và Scopus trong giai đoạn từ năm 2010 đến năm 2023 cùng với tài liệu kỹ thuật từ nhà sản xuất. Tiêu chí lựa chọn nghiên cứu bao gồm các báo cáo về hiệu quả, độ nhạy, độ đặc hiệu và các hạn chế của kỹ thuật MALDI-TOF MS trong định danh NTM.
Kết quả và kết luận: Tổng cộng 23 nghiên cứu và bài báo quốc tế đã được lựa chọn đưa vào phân tích, bao gồm 3 tài liệu liên quan đến kỹ thuật MALDI-TOF MS và quy trình thực hiện, cùng 20 tài liệu về kết quả định danh NTM bằng kỹ thuật này. Tại Việt Nam hiện chưa có nghiên cứu nào về ứng dụng MALDI-TOF
MS trong định danh loài, dưới loài NTM. Kết quả tổng hợp cho thấy, tỷ lệ định danh đạt mức độ tin cậy cao (Score ≥ 1,80) trung bình là 88,0% ( 95% CI 80,0 - 93,2), so với các kỹ thuật tham chiếu (LPA và/hoặc giải trình tự gen) có cùng kết quả định danh đạt 97,0% (95% CI 91,5 - 99,4). Kết quả định danh bằng MALDITOF MS tương đồng hoàn toàn (100%) với kỹ thuật định danh tham chiếu (LPA và/hoặc giải trình tự gen) ở các loài là M. chimaera, M. intracellulare, M. gordonae và M. fortuitum group. Tuy nhiên có 3 trường hợp (3%) không định danh được loài, gồm 2 mẫu M. avium và 1 mẫu M. abscessus complex. Đặc biệt, kỹ thuật MALDI- TOF MS giúp rút ngắn thời gian định danh gấp 7 lần và chi phí thực hiện giảm 3 lần so với các kỹ thuật tham chiếu khác. Tuy nhiên, đối với các mẫu không định danh được hoặc có độ tin cậy thấp phải được khẳng định lại bằng LPA.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
MALDI- TOF MS, Nontuberculous Mycobacteria (NTM), Định danh NTM
Tài liệu tham khảo
2. Riello FN, Brígido RTS, Araújo S, et al. Diagnosis of Mycobacterial infections based on acid-fast bacilli test and bacterial growth time and implications on treatment and disease outcome. BMC Infect Dis. 2016;16:142.
3. Pennington KM, Vu A, Challener D, et al. Approach to the diagnosis and treatment of non-tuberculous Mycobacterial disease. J Clin Tuberc Other Mycobact Dis. 2021;24:100244.
4. Yin X, Zheng L, Wu L, et al. Comparative evaluation of two rapid methods for differentiating Mycobacteria. Tuberculosis (Edinb). 2013;93(2):227-231.
5. Lee RS and Behr MA. The implications of whole-genome sequencing in the control of tuberculosis. Ther Adv Infect Dis. 2016;3(2):47-62.
6. Kakhki RK, Aryan E, Meshkat Z, et al. Development of a cost-effective line probe assay for rapid detection and differentiation of Mycobacterium Species: A Pilot Study. Rep Biochem Mol Biol. 2020;8(4):383-393.
7. Rodriguez-Temporal D, Alcaide F, Mareković I, et al. Multicentre study on the reproducibility of MALDI-TOF MS for nontuberculous Mycobacteria identification. Sci Rep. 2022;12(1):1237.
8. Mediavilla-Gradolph MC, De Toro-Peinado I, Bermusdez-Ruiz MP, et al. Use of MALDI-TOF MS for Identification of Nontuberculous Mycobacterium Species Isolated from Clinical Specimens. Biomed Res Int. 2015;2015:854078.
9. Saleeb PG, Drake SK, Murray PR. Identification of Mycobacteria in Solid-Culture Media by
Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry | Journal of Clinical Microbiology. J Clin Microbiol. 2011;49(6):1790-1794.
10. Alcaide F, Amlerová J, Bou G, et al. How to: identify non-tuberculous Mycobacterium species using MALDI-TOF mass spectrometry. Clin Microbiol Infect. 2018;24(6):599-603.
11. El Kheschine A, Couderc C, Flaudrops C, et al. Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Timeof-Flight Mass Spectrometry Identification of Mycobacteria in Routine Clinical Practice. PLoS One. 2011;6(9):e24720.
12.Oliva E, Arosio M, Mazzola E, et al. Rapid identification of non-tuberculous Mycobacteria with MALDITOF mass spectrometry. Infez Med.2021;29(1):79-84.
13. Bagnarino J, Barbarini D, Russello G, et al. Mycobacterium chimaera Identification Using MALDI-TOF MS Technology: A Practical Approach for the Clinical Microbiology Laboratories. Microorganisms.2022;10(6):1184.
14. Saleeb PG, Drake SK, Murray PR, Zelazny AM. Identification of Mycobacteria in Solid-Culture Media by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry. J Clin Microbiol. 2020 Dec 21;49(5):1790-4.